L'ECERI est aujourd'hui financée par ses membres, qu'ils soient fondateurs (son principal financeur est l'ARTAC)- ou partenaires contractuels tels que les laboratoires de biologie privés, dans le cadre d'un travail collaboratif. Cependant, ces fonds ne permettent pas à l'ECERI de conduire ses programmes de recherche. Etant donné la nature et l'étendue de ses objectifs et activités, et son engagement absolu d'objectivité scientifique, l'ECERI privilégie trois types de financements :
- de fondations privées à but non lucratif engagées dans le soutien à des projets de recherche sur la santé et l'environnement,
- de contrats de recherche avec des partenaires médicaux ou scientifiques pour conduire des études collaboratives sur des sujets spécifiques,
- de l'Union Européenne, le programme de recherche de l'ECERI répondant aux objectifs du Programme de Santé de la Communauté Européenne.

L'ECERI  a besoin de soutien financier pour mener les projets de recherche issus des quatre axes de recherche suivants:

- Environnement, mitochondrie et métabolisme, incluant entre autres, l'étude du biomarqueur BM2607/05,
-  Eeffets sur la santé des champs électromagnétiques,
-  Stress psychologique et cancer,
- Pesticides, alimentation et cancer.

La recherche de mécénat est en cours; toute proposition de collaboration peut être soumise à cette adresse : sg.eceri@gmail.com.